Trong năm 2021 công tác phòng, chống dịch bệnh Covid-19 trên địa bàn thành phố được các cấp, các ngành, cả hệ thống chính trị tập trung thực hiện quyết liệt, linh hoạt, sáng tạo với tinh thần “chống dịch như chống giặc”; huy động sự vào cuộc của toàn xã hội với phương châm “4 tại chỗ”; phát huy vai trách trách nhiệm của thôn, tổ dân phố, tổ giám sát và tuyên truyền phòng chống dịch Covid-19 trong cộng đồng; ý thức tự giác tham gia phòng, chống dịch của người dân. Trong năm 2021, thành phố ghi nhận 620 ca dương tính, trong đó có 374 ca cộng đồng; 217 ca bệnh là F1 đã được giám sát cách ly; 29 ca bệnh từ các địa phương khác về. Trong đó đa số các ca bệnh xuất hiện tập trung trong giai đoạn từ tháng 11 đến 31.12.2021 với 607 ca. Thành phố đã thành lập được 20 khu cách ly, đã tiếp nhận cách ly tập trung 2.515 trường hợp. Trên địa bàn thành phố có 04 cơ sở thu dung điều trị bệnh Covid-19, thực hiện tiếp nhận 577 bệnh nhân, 320 trường hợp khỏi bệnh, còn 267 trường hợp đang điều trị. Trong năm 2021, thành phố thực hiện chủ trương đón 581 người dân Tam Kỳ từ Thành phố Hồ Chí Minh, thành phố Đà Nẵng về quê với tổng 4 đợt. Về công tác tiêm vắc xin phòng Covid-19, UBND thành phố đã triển khai 23 đợt tiêm vắc xin phòng Covid-19 cho toàn dân trên địa bàn thành phố. Đối tượng 18 tuổi trở lên đã tiêm mũi 1 đạt 99,6%; mũi 2 đạt 98,5%; và đang thực hiện tiêm mũi 3. Trẻ từ 12 đến dưới 18 tuổi tiêm mũi 1 đạt 96,9%; Mũi 2 đạt 84,1%.
Tại hội nghị, đại diện các ngành, địa phương đã nêu lên những khó khăn trong công tác phong chống dịch, trong đó tập trung ở nguồn nhân lực của ngành y tế; những bất cập trong công tác điều trị tại nhà cho F0; các phương án xử lý khi có F0 trong trường học; v.v. Các đại biểu cũng đã đề xuất một số giải pháp tháo gỡ khó khăn để tiếp tục triển khai phương án phòng chống dịch hiệu quả trong năm 2022, trước mắt là tập trung phòng chống dịch đảm bảo trong dịp tết nguyên đán Nhâm Dần. Dịp này, 60 tập thể và 194 cá nhân đóng góp quan trọng trong công tác phòng, chống dịch năm 2021 đã được tuyên dương khen thưởng.